卷首自序、总目、卷一调治三焦、胸痹、胸胁及心腹胀满冷痛、下痢、咳嗽上气奔豚、水肿诸方；卷二治头面风、喉痛、暴厥、中风、狂妄噤痉、脚弱诸方，卷三治泻痢、虚劳、遗精、失眠诸方；卷四治霍乱、中恶、食毒、血证、发黄诸方。卷五治鬼魅、狂癫诸方；卷六治冬月伤寒、春夏温热病、秋月中冷诸方；卷七治女子众病、无子、妊胎、产后、崩事、宿疾诸方；卷八治少小百病诸方；卷九服食及寒食散诸方；卷十治外科诸病及金疮、溺水、入井冢闷冒诸方；卷十一述本草药性；卷十二灸法要穴。此书比较重视对伤寒、天行温疫等传染性热病，对内科疾病如瘿病（地方性甲状腺肿）、脚气病等有较深的认识。